Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BB287469Q3UT53 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BB287469Q3UT53 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms