Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Klhdc9Q3USL1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc9Q3USL1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms