Protein–RNA interactions for Protein: Q3URD2

Rprml, Reprimo-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmlQ3URD2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RprmlQ3URD2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmlQ3URD2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms