Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5460Q3UQ97 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gm5460Q3UQ97 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5460Q3UQ97 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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