Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms