Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SbsponQ3UPR9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SbsponQ3UPR9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SbsponQ3UPR9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SbsponQ3UPR9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SbsponQ3UPR9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SbsponQ3UPR9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SbsponQ3UPR9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SbsponQ3UPR9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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SbsponQ3UPR9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsponQ3UPR9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms