Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nlrc4Q3UP24 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nlrc4Q3UP24 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms