Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skap2Q3UND0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms