Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cln5Q3UMW8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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