Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cobll1Q3UMF0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms