Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cog7Q3UM29 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cog7Q3UM29 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cog7Q3UM29 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cog7Q3UM29 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cog7Q3UM29 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cog7Q3UM29 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cog7Q3UM29 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms