Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spg7Q3ULF4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms