Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ceacam12Q3UKP4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam12Q3UKP4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam12Q3UKP4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam12Q3UKP4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam12Q3UKP4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam12Q3UKP4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam12Q3UKP4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam12Q3UKP4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam12Q3UKP4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam12Q3UKP4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms