Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pcgf5Q3UK78 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms