Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sf3b2Q3UJB0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b2Q3UJB0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms