Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmed8Q3UHI4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmed8Q3UHI4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed8Q3UHI4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed8Q3UHI4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms