Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf166Q3U9F6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rnf166Q3U9F6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf166Q3U9F6 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms