Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U1D9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U1D9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3U1D9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3U1D9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U1D9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U1D9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U1D9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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