Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc28Q3TX51 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc28Q3TX51 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc28Q3TX51 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms