Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm2Q3TWN3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnnm2Q3TWN3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms