Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
XylbQ3TNA1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XylbQ3TNA1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms