Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrx1Q3TL44 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrx1Q3TL44 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms