Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2f1Q3THK3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2f1Q3THK3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2f1Q3THK3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms