Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VrtnQ3SYK4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VrtnQ3SYK4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VrtnQ3SYK4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms