Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prex2Q3LAC4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prex2Q3LAC4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prex2Q3LAC4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms