Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnnm3Q32NY4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnnm3Q32NY4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnnm3Q32NY4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm3Q32NY4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm3Q32NY4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm3Q32NY4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm3Q32NY4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm3Q32NY4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm3Q32NY4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnnm3Q32NY4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms