Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col24a1Q30D77 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col24a1Q30D77 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms