Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna5Q2MKA5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna5Q2MKA5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms