Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox4dQ2MDG0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox4dQ2MDG0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms