Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1123Q1RME4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1123Q1RME4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1123Q1RME4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1123Q1RME4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1123Q1RME4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1123Q1RME4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm1123Q1RME4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm1123Q1RME4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm1123Q1RME4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm1123Q1RME4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm1123Q1RME4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm1123Q1RME4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm1123Q1RME4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm1123Q1RME4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm1123Q1RME4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm1123Q1RME4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm1123Q1RME4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm1123Q1RME4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm1123Q1RME4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms