Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam171bQ14CH0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Fam171bQ14CH0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam171bQ14CH0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam171bQ14CH0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms