Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q149G0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q149G0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q149G0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q149G0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q149G0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q149G0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q149G0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q149G0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q149G0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q149G0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q149G0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q149G0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q149G0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q149G0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q149G0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q149G0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q149G0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q149G0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q149G0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q149G0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q149G0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q149G0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q149G0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q149G0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q149G0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q149G0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q149G0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q149G0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q149G0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q149G0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q149G0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q149G0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q149G0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q149G0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q149G0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q149G0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q149G0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q149G0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q149G0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q149G0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q149G0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q149G0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q149G0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q149G0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q149G0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Q149G0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q149G0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q149G0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q149G0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q149G0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q149G0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms