Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Perm1Q149B8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Perm1Q149B8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Perm1Q149B8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms