Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VgfQ0VGU4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VgfQ0VGU4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms