Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gli2Q0VGT2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gli2Q0VGT2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms