Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b3Q0VF55 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b3Q0VF55 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms