Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb8Q0VBD0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb8Q0VBD0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms