Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap5cQ0V8T7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cntnap5cQ0V8T7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms