Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Vps8Q0P5W1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps8Q0P5W1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps8Q0P5W1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms