Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SobpQ0P5V2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SobpQ0P5V2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SobpQ0P5V2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms