Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Neurl1bQ0MW30 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Neurl1bQ0MW30 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms