Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf541Q0GGX2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf541Q0GGX2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms