Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cass4Q08EC4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms