Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc4Q08624 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms