Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata4Q08369 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gata4Q08369 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms