Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Col9a2Q07643 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col9a2Q07643 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col9a2Q07643 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms