Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Col17a1Q07563 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Col17a1Q07563 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Col17a1Q07563 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms