Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdx4Q07424 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms