Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Siah1bQ06985 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms