Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CluQ06890 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CluQ06890 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CluQ06890 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CluQ06890 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CluQ06890 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CluQ06890 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CluQ06890 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CluQ06890 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CluQ06890 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CluQ06890 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CluQ06890 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CluQ06890 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CluQ06890 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CluQ06890 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CluQ06890 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CluQ06890 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CluQ06890 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CluQ06890 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CluQ06890 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CluQ06890 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CluQ06890 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CluQ06890 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CluQ06890 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CluQ06890 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CluQ06890 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CluQ06890 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CluQ06890 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CluQ06890 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CluQ06890 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CluQ06890 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CluQ06890 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CluQ06890 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CluQ06890 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CluQ06890 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CluQ06890 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CluQ06890 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CluQ06890 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CluQ06890 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CluQ06890 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CluQ06890 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CluQ06890 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms